В июне 2011 года авиакомпанией ЗАО «Скай Экспресс» были допущены массовые задержки авиарейсов из аэропорта Внуково. Авиакомпанией не были выполнены требования законодательства о резервировании воздушных судов для выполнения воздушной перевозки пассажиров, а также об организации для пассажиров услуг по обеспечению горячим питанием, прохладительными напитками и размещению в гостинице. В связи с чем, 23.06.2011 Московской прокуратурой по надзору за исполнением законов на воздушном и водном транспорте в отношении ЗАО «Скай Экспресс» было возбуждено дело об административном правонарушении по ч.3 ст.14.1 КоАП РФ.
Решением Арбитражного суда г.Москвы от 10.08.2011 ЗАО «Скай Экспресс» привлечено к административной ответственности с назначением административного штрафа в размере 30000 рублей.
Указанное решение суда ЗАО «Скай Экспресс» было обжаловано. В апелляционной жалобе указывалось на нарушение норм процессуального права.